Короткий ответ
Для российского бизнеса Метрика обязательна: у неё точнее данные по Яндексу, есть вебвизор и прямая связка с Директом. Ставить обе имеет смысл, если значимая часть аудитории из Google. Данные при этом всегда будут немного расходиться — это нормально.
Что проверить на практике
- Счётчик без настроенных целей показывает посещаемость и ничего не говорит о деньгах
- Код должен стоять на всех страницах — иначе часть визитов теряется молча
- Два счётчика на одном сайте задваивают статистику: типовое наследие смены подрядчика

